Захожу в скайп, а через время он сам вырубается. Я пытаюсь зайти, а он пишет "Ошибка ввода-вывода диска. " Потом пишет, что бы перезапустила скайп, но когда я перезапускаю выскакивает тоже самое. Что делать?

Нужно удалить временные файлы и файлы истории вручную, все что связано со скайпом и потом перезапустить/переустановить скайп.
Диск:\Users\Юзер\AppData\Roaming\Skype - здесь

рестарт пробовала?

Именно такая ошибка выскакивает тогда, когда пытаешься запустить вторую копию Скайпа.