Те, кто пишет дипломку (или писал) заявление о теме дипломной работы на чье имя писать? Ректору? Или в секретариат?

Зависит от универа и факультета.
Спроси у методички своей.
Я писал заместителю директора программы.

заведующему кафедры вроде

Ректору. Только не "Хей, друг - я не в теме!" а нормальным литературным гос-языком. ;) В общем, тому от кого услышал ту самую тему.

у всех же по-разному. Надо писать для начала где ты учишься и тогда тебе дадут совет более конкретный. Ёпти:)