Как изменить файловую систему на диске ?

ничего форматировать не надо. Достаточно выполнить в командной строке следующее:

convert C: fs:NTFS /x
(вместо C: возможно придётся подставить другую букву, в зависимости от того, какой диск нужно отконвертировать).

при этом появится сообщение, что на время конвертирования (как правило быстрое по времени) данный диск будет недоступен. Если же это системный диск, то потребуется разовая перезагрузка. Об этом тоже вы будете предупреждены. И после ближайшей перезагрузки том будет автоматически переконвертирован в NTFS.

подключить и отформатировать под ntfs.

Ну как, как. Втыкаешь его в усб порт, устройство устанавливается.
Заходишь в my computer.
Правый клик по устройству, format. В списке ищешь ntfs. Если его там нет, то нужно специальное ПО.

Качать ПО советую с softpedia.com.

При формате диска полюбому можно выбирать либо ФАТ32 либо НТФС.