Если в дочернем предприятии происходят какие-то существенные перемены, то предприятие владелец принимает решение или само дочернее предприятие?

Обычно у материнской фирмы всё же больше полномочий. Если правильно всё создано, то материнская фирма контролирует дочку в нужных ей пределах.
Но у руководства дочерней компании тоже много полномочий, и при желании это руководство может многое натворить: увести активы, перехватить клиентов, переманить сотрудников, и т.п. В общем, однозначных ответов тут нет. Почти всё это определяется в уставе дочерней компании и зависит от личности руководителя дочки.

Бывает и так и так. Зависит от характера изменений

Вообще дочернее предприятие это как второе, все кардинальные изменения принемает владелец или акционеры во главе

эххх, устав бы почитать :)