Покупал сигареты, попросили документы и вбили персональный кода в какую-то базу, что за прикол такой и на сколько он законен?

Родителям сообщат. Все законно.

надо было это в магазине выяснять

Интересненько, а почему ты у них не спросил, что они за процедуру проводят?

Может молодо выглядишь и часто покупаешь, поэтому они ввели данные, чтобы, если будет проверка, их не оштрафовали.
Может подозрительный и ввели данные, мало ли подставная утка.
Может не похож на паспорте и есть подозрения, что это не твой.
Может ты в каком-то игровом заведении покупал, а там регистрируют клиентов.
Может кто-то похожий обворовал магазин и есть подозрения, что это ты, проверят по базе, мало ли где-то засветился.
Всякое может быть, но я не верю, что тебе не сказали причину, как-нибудь, но они отмазываются.

ты имеешь право не давать документ продавцам, а они в свою очередь имеют право не продавать тебе ничего. в данной ситуации я вижу, что ты дал документы по своему личному согласию без обмана и принуждений и т.п.
иными словами все в норме

Вообще-то - это не законно(без твоего согласия), но так как ты дал в руки свой документ постороннему, значит ты дал согласие на действия которые предусматриваются посторонним лицом.