Почему иногда бывает, что определенному человеку не комфортно смотреть в глаза (даже если знакомы уже довольно давно)?

может потому что с ним тебе приходится быть не совсем собой. это нормально, такое бывает, когда люди просто не могут быть искренними друг с другом не в плане обмана, а в плане открытия всех чувств и эмоций друг другу. и появляется обманное ощущение, будто обманываешь его в чём. не смотришь в глаза, т.к. стыдно за этот несуществующий обман, пусть и всё это творится глубоко в подсознании.

Может потому что --->

Люди разное , так как симпатии и антипатии

Может этот человек смотрит на тебя взглядом педофила ?  

Глаза - это зеркало души. Загляни в них поглубже и ты найдёшь там ответы.

cheloveka podsoznateljno vosprinimaesh kak sopernika, net doverija + neuverennostj v prevoshodstve nad nim

У тебя социофобия