действует ли атмосферное давление на объекты под водой?

Как по-научному - не знаю. Думаю да. Как минимум косвенно.

действует, но по сравнению с давлением самой воды - крайне незначительно.

Да - это знает каждый рыболов

Да. При этом давление воды и воздуха над ней складывается.

Давление под водой (в барах) рассчитывается по формуле  P = D/10 + 1, где
P - абсолютное давление;
D - глубина в метрах;
А единичка в формуле - давление воздуха над водой (1 атмосфера/бар)

Это я тебе как старый дайвер говорю :)