Где лучше спать на двухъярусной кровати(в общаге)?

Нижняя койка лучше. Конечно,на гражданке, по подъему-отбою, туда-сюда прыгать не нужно, но, нижний ярус, можно легко занавесочкой прикрыть, создав какое-никакое личное пространство. Да и до тумбочки дотянутся проще.

На верху, у окна - козырное место.
Внизу у входа или у туалета - не очень.

в армии есть мнение - внизу спят деды, им так легче вставать и ложиться, они же старенькие.  
а мнение молодых из той же армии - когда спишь наверху то на лицо с верхнего матраса ничего не сыпется.

наверху.
теплее.

Снизу. На верхнюю - забересь/слезь и так до бесконечности.

где удобнее,там и спи

В низу, от входа с правой стороны в конце от двери.
p.s. так по понятиям размещаются смотрящие, а так-же разного рода авторитеты(если в камере-хате) нет смотрящего.