Если юридическое лицо покупает телефон в магазине, как должна выглядеть сделка, если нет возможности вписать реквизиты покупателя в чек?

Просто выписывают счет на те реквизиты, что ты указал при оформлении заказа в интернет магазина, присылают тебе его на указанный тобой адрес эл. почты. Заходишь в свой интернет банк, оплачиваешь счёт и затем получаешь свой товар. А, если в обычном магазине, тогда точно также, они все данные укажут в накладной, а чек просто выбьют без реквизитов и прикрепят степлером к накладной.

К чеку делают накладную.  (Upd - чек это уже совершенная сделка, т.е. оплаченная, так что в комплекте к чеку делают накладную, всё верно).