Какой программой можно проверить - всле ли файлы системы на месте, или какието пропали из за вирусов ?

1.откатить систему на какой то промежуток времени если примерно знаешь когда вирусняк подловил ) 2.скачать антивирус,+ троян ремувер проверить систему почистить рест :) а вообще лучше все таки снести винду ^^

1. Какие файлы?
2. Лечение документов выполняется антивирусной программой. Если она может.
    Лечение системы будем считать невозможным, следует уничтожить её и переустановить с нуля.
3. Что такое манду и зачем вы это так называете?
4. Почитал описание Win32.Sali - http://www.securelist.com/ru/descriptions/190481/Virus.Win32.Sality.t
    Система поражена. Её следует уничтожить и переустановить с нуля.
5. Следует обдумать, какие нормы безопасности вы нарушали. Лечить что-либо бесполезно, пока вы не устраните причину заражения.
    Судя по описанию вируса, вы злоупотребляли привилегиями Администратора, постоянно работая в системе с повышенными привилегиями.
    Следует обдумать, зачем вы это делали и больше не нарушать (но уже на новой, чистой системе).

Не факт, что найдёт, даже если оно там и есть. Антивирусные программы технически не могут знать всё о всех вирусах в мире.
После установки может проявиться, а может и не проявиться. Такие вещи, как rootkit или hypervisor вообще могут никак себя не показывать и не обнаруживать.

Для защиты от вирусов вам следует выполнять нормы безопасности, и первая из них - никогда не заходить в систему с привилегиями Администратора без должной на то необходимости.
Что касается инсталляционных ресурсов, то брать их следует исключительно в оригинальном либо действительно доверенном источнике, никаких "я на компьютерном сайте скачал" или "мне друг дал".

http://www.softbroker.ru/pages/antivirus  можешь пройти по ссылке и глянуть рейтинг антивирусников, что думает народ! Я предпочитаю проверять Доктором Вэбом систему

daa mozno... zdelaj quarantine. i pri etom ix mozno le4itj, antiviruss sam vile4it jesli smozet!

хм...как ты проверешь файл находящейся на другом компе (сервере) от вирусов ?
только когда он пападает к тебе (начинает), тогда твой антик может его просканировать.
главное чтобы антик нормальный был.

У тебя вирус в системе,скорее всего. Он-то всё и блокирует.
Либо руками попробуй удалить в безопасном режиме. Либо откат системы попробуй сделать на дату, когда проблем таких не было.
Либо из под ДОСа вылечить...

  Он через что угодно может пробраться, если устройства между собой чем-либо подключены..

Хорошая попытка, Морковные жопки