иногда баннеры ставят как в поддержку проекта, я лично так на блоге мучу, но на корпаративных..
может просто им за это отлично платят? я лично когда делал сайты меня часто заставляли всунуть баннер куда его лучше не вставлять , но увы , бывают толстолобики...(но бывает и нет) правда это было не в таких маштабах как ты рассказываешь)) так что не всегда в этом виноваты вебмастера , а иногда и заказщики, которым до этого наговорили всякого)