Как разместить на своем сайте онлайн платеж или онлайн подписку, допустим на журнал?

Ну, самый простой и дешёвый способ - системы платежей на вроде PayPal, WebMoney и т.д. Вариант подороже - заключить договор с FirstData или DnB NORD на подключение к их интернет-терминалу (для оплаты карточками). Самый дорогой вариант: заключать договора с каждым банком для подключения терминала для оплаты через интернет-банк. Дорого, потому что надо именно с каждым по отдельности договариваться. Как-то так.

СМС или Перечесление?

понятия не имею =\

Схему понимаю, но туда не лезу, да и Дедушка Мороз (ну тот кто ещё по пьяни ходит в Красной шляпе в аватарке), тебе всё прекрастно разяснили