Можна установить FreeBSD без форматирования ВСЕГО HDD?

Можно просто запустить через виртуальную машину, инсталировать даже не надо. Советую программу Vmware.

Можно, используюя какой-нибудь менеджер партиций. Я ставил через Acronis, Винда и Фри на один хард... Относительно других способов - не знаю, не пробовал.

Можно установить, на другую партицию.  

ручной режим и выбор нужного раздела, вместо всего диска

Конечно. Читай просто внимательно, че спрашивают.

Partition Magic, или Partition Expert :) (это программы)