Посоветуйте хороший шифровщик файлов.

"Посоветуйте хороший размер обуви".
В вопросе не обозначены условия применения шифрования. Это влияет на весь проект в корне.

Encrypted File System. Встроенное свойство Windows NTFS, работает с применением цифровых сертификатов. Нужно изучать целый том документации.

Или WinRAR. 256-разрядное шифрование AES. Но оба инструмента имеют разное применение.

BestCrypt Traveller - для флешки не заменим :) не требует установки сторонних программ.

Согласен с WindowsNT - чтобы посоветовать подходящую программу нужно более точно знать для чего именно это будет применяться.

Еще одна программа для шифрования данных - это TrueCrypt. Программа бесплатная. Позволяет зашифровать любой раздел жесткого диска в системе, флешки, или же создавать зашифрованные файлы-контейнеры. Работает это примерно как ISO и Daemon Tools - такой зашифрованный контейнер "вставляется" в виртуальный диск, затем работа с таким виртуальным разделом идет как обычно. Шифрование будет происходить "на лету" в фоновом режиме - при копировании файлов в этот контейнер они шифруются, при извлечении - дешифруются. Шифрование "прозрачно" для операционной системы. Даже на "слабых" машинах потеря производительности незаметна.

Такой зашифрованный контейнер можно переносить на другой компьютер.

Сам TrueCrypt установки не требует, можно просто воспользоваться копией необходимых файлов. Программа не оставляет следов работы в системе.