безопасно ли регистрироваться для поступления в ВУЗы по сайту http://www.latvija.lv/studijas? или лучше приходить и на месте подавать заявки?

Безопасно. Можешь, конечно, прийти, в общей очереди постоять, но легче и приятнее воспользоваться благами цивилизации и потратить на подачу документов 30 минут (включая посещение вуза для подтверждения регистрации), а не 3 часа.

Безопасно, но я когда подавала, ходила сама, чтобы точно ничего не перепутать при заполнении форм и не ходить лишний раз подтверждать заявку.

Ну вообще-то все равно надо идти в ВУЗ для подтверждения регистрации. А регистрироваться на сайте конечно безопасно, и если все составят список сначала на сайте, а только потом прийдут в вуз для подтверждения будет быстрее и легче, а то эти огромные очереди, просто бред