.да нет наверное.наверняка каждый из нас использовал данную фразу. интуитивно понятна, но абсурдна если вдуматься. в других языках мира есть нечто подобное?

так если разобрать, ничего в этой фразе "да нет, наверное" нет такого. дело в том, что первое "да" - это не частица утверждения, а соединительный союз, который даже запятой не выделяется. например, "да ты что, обадел?". то есть используется для соединения с выссказанной мыслью или в качестве продолжения внутреннего монолога. так что в качестве смыслоносителей остаются "нет, наверное" - фраза, выражающая неуверенность, не более того.

"Да" в русском не является только утвердительной частицей, но и соединительным союзом. Например "дружно да ладно", "взял да и побежал". И в фразе "да нет, наверное" именно в такой роли и выступает.

В каждом языке есть подобные вещи с многозначными словами. Не знаю насчёт именно многозначности подтверждающей частицы в других языках (а из поряка 6000), но наверняка это не уникальный случай.

только в русском языке

использовал ,  в других языках -нет