В этой поговорке яблоко означает потомка, яблоня — предка, а "недалеко падает" — обладает похожими чертами, поскольку вырастает на той же почве.
Так говорят, когда хотят сказать что сын/дочь обладает теми же чертами (отрицательными) которые есть у отца/матери, ведет себя так же (отрицательно), как и они, идет той же дорожкой (плохой), что и они и т. д.