Вообщем система такая,делаю почти одинаковые упражнения по количеству,на разные группы мыщц,впринципе,но почему-то какие-та болят мышцы а какиета нет почему не всё болит?

Значит, какие то мышцы более подготовлены изначально к физическим нагрузкам, их проще тренировать (качать), и на них можно делать большую нагрузку

одними мы мышцами пользуемся постоянно - разминка в течении всего дня, а какими то почти не пользуемся, вот и болят, наверно
Ну трицепсом меньше пользуешься похоже, вот и болеть начинает :D

скорей всего, плохо делаешь разминку перед тренировками, как бы мы одинаково не делали нагрузки, все равно одна мышца тянется, другая нет.
вот пример такой - разминка идет на шпагат одинаково на обе ноги, тянется все тоже одинаково, но, на правую ногу ты можешь сесть легко, а левая все равно тянется, как бы ты одинаково не делал все.

может дело в степени нагрузки? Веса увелит на те мыщцы что не болят и посмотри что будет.

Боль не всегда является показателем.
Показатель прогресса зависит от цели твоих занятий.
Если задача поднять макс. вес - рост силовых в каждом из упражнений и есть показатель прогресса.
Бодибилдинг - увеличение мышечной массы.
Функциональный тренинг - увеличение количества повторов за промежуток времени.
Все остальное - вторично.

В дополнение.

Дать абсолютно равномерную нагрузку весьма сложно.
Например в подтягиваниях средним хватом, задействованы не только мышцы спины, но и бицепс.
А в жиме лежа работают также плечи и трицепс. Т.е. если у тебя в этот день даже нет упражнений на плечи, нагрузка все равно идет.
Еще одной причиной может быть перетренерованность.
Также существуют анатомические особенности каждого атлета. Т.е. определенные упражнения для тебя не работают.