Как сделать чтобы у наушников SS Siberia V2 не было слышно всех звуков которые на компе?

это не в наушниках дело! в настройках покапатся надо! Control Panel / Audio / дальше нужно искать настройки записи или МИКС ВАФ. както так.  ещё в самом скайпе тоже настройки просмотреть надо!

Если музыка играет в колонках, а в Скайпе ты сидишь в наушниках, то логично : микрофон принимает и передаёт все без исключения звуки.
Попробуй выключать музыку, когда общаешься в Скайпе...если она мешает.