Может быть так что скайп аккаунт в сети, хотя на самом деле программа закрыта у пользователя ? В течении дня

да ) вчера бился над этой проблемой, вот эти 2 команды помогли:
/showplaces    
/remotelogout
забиваешь в любом чате.
Выходя меняешь статус на "не в сети" и будет тебе счастье )
или откатывайся на 6,11,0,102

ага, как только я начала использовать скайп через телефон, эта сволочь в сети круглосуточно! при чём это совсем не значит, что я в скайпе. я могу быть даже в глубине самой забытой глубинки в дали от всяческих вай-фаев, а он, гад, будет в сети

Устанавливаешь статус не беспокоить -это самый красный значок и никто тебе ни сообщений ни видеть что в сети не будет.

Скайп с отключенным автоапдейтом делает ночью, в тихую, апдейт и наверное думает что я не замечу. Отталкиваясь от этого я предполагаю что он может творить что угодно.