Процессор загружен на 100%, что на винде что на свежеустановленной убунте, в чём может быть дело?

Причины стопроцентной загруженности процессора могут быть самые разные, но начинать их обнаружение нужно в любом случае с программной диагностики.
Дела обстоят сложнее, если причина загруженности процессора не программная, а аппаратная. Самая распространенная причина это перегрев. Если на недавно установленной операционке при системных процессах загрузка составляет 100% - это наверняка перегрев.
  Установите программу для проверки температуры процессора. Обычно такие утилиты идут в комплекте поставки к материнским платам. Если она покажет высокую температуру в зоне процессора (более 70°С), то все ясно. Происходит это потому, что при высокой температуре ядра процессор пытается максимально обезопаситься и продлить время работы системы. Из-за этого новые процессы, которые могут его еще больше разогреть, блокируются таким вот образом.

В таком случае надо прочистить систему охлаждения процессора. Процедура во многом аналогична той, что применяется для видеокарт: http://fotos.ua/articles/477/
Откройте корпус компьютера и осмотрите радиатор, установленный над процессором. Если он забит пылью, то почистите его, используя щеточку. Как вариант – пылесос (на выдув) или фен. После этой процедуры температура в этой области должна снизиться.

Реже встречается перегрев чипсета. Это тоже может быть причиной 100% загрузки процессора, правда здесь уже вступают в игру защитные механизмы материнской платы. Поскольку на большинстве материнских плат используются пассивные механизмы охлаждения, придется поработать над охлаждением корпуса. Установите хотя бы один 120-мм вентилятор и проверьте температуру чипсета. Делается это при помощи все той же программы, что проверяет температуру в зоне процессора.
Напоследок можно добавить, что для борьбы с перегревом процессора эффективным является установка мощного кулера.

выключено второе йидро в биосе или нужно на анлоке галочку поставить