Kак удалить Windows если их двое в загрузке?

Если они обе на одной партиции, то никак. Удалить обе, потом проинсталлировать новую. Ну или на крайняк просто из другой Win стереть папку самой Windows которая вторая.
Если они на разных партициях, (дисках), то просто банально форматнуть тот диск. Не забываем, что документы и программы могут находиться не только на той, где от них Windows, т.е. вначале убеждаемся что там кроме Windows ничего полезного нет, потом форматируем

А само меню загрузок редактируется либо правкой boot.ini (для ХР) либо при помощи програмки EasyBCD 1.7.2.exe для Висты и Семёрки

Мы не очень способны телепатировать, какие у вас версии Windows и как так оказалось, что показывается две.
Без этой информации помогать не в чем.

То есть, угадывать с boot.ini или bcdedit можно, но это только догадки, которые не факт, что помогут.

Удаляешь их из списка в