Место на жестком диске занято больше чем указано , почему?

Скрытая папка System Volume Information содержит резервные копии системы (shadow copies, system restore).
Это важная вещь, не стоит трогать.

Восстановление системы отключал? Если нет будет и дальше отжирать помаленьку. Хотя 64 гига многовато конечно для нее.

Помимо этих папок, есть ещё и скрытые... например Temp... где может скапливаться иногда до 100 гигов. Это раз.
Во-вторых есть ещё пару функций самой винды, которые потихонечку отгрызают место, но сами за собой не подчищают старое ненужное.

А, да, иногда (но очень редко) сбивается сама разметка диска. И без формата тут не обойтись. Но, думаю, это не твой случай ))

Скрытые папки :)