Позвонил в ВИД и спросил почему за 2015ый год нет переплаты налога. Мне сказали что я отработал все 12 месяцев, и поэтому переплаты нет. А в чём логика?

Потому что за тебя заплатили столько, сколько и должны. Расчет налога происходит предположительный налог за год. И за этот год и платят. Отработал меньше, все что переплатили возвращают.

Все правильно. Переплата(и соответственно возврат) бывает когда неполный год работаешь.